Sắp xếp lại phạm vi mục tiêu

Sắp xếp lại phạm vi mục tiêuGiới thiệu:

Biểu sinh học (epigenetics) là một trong những điểm nóng hiện nay trong nghiên cứu sinh học phân tử, và trình tự methyl hóa DNA là một phần quan trọng của biểu sinh học, một trong những hình thức sửa đổi biểu sinh chính của DNA trong bộ gen. Methyl hóa DNA đề cập đến một cách sửa đổi để chuyển nhóm methyl lên cơ sở cytosine, được xúc tác bởi DNA methyltransferase (DNMT). Nó xảy ra chủ yếu ở các khu vực giàu đảo Bisnucleotide CpG. Thông thường, đảo CpG tồn tại ở dạng không methyl hóa (dạng hoạt động), và methyl hóa DNA có thể dẫn đến biểu hiện gen bị im lặng. Hoạt động bất thường của DNMT có liên quan chặt chẽ đến bệnh. Nó đóng một vai trò quan trọng trong việc duy trì chức năng tế bào bình thường, truyền các dấu ấn di truyền của bộ gen, sự phát triển của phôi và sự xuất hiện của khối u ở người.

Thượng Hải Wing và Bio được xử lý bằng hydrogen sulfite (bisulfite), khuếch đại các mảnh mục với nhiều PCR, thêm barcode và giải trình tự chung khớp, trong Illumina X10Sắp xếp lại phạm vi mục tiêuNền tảng tiến hành giải trình tự thông lượng cao các sản phẩm PCR, sử dụng phương pháp tin sinh học để tính toán chính xác trạng thái methyl hóa của các vị trí methyl hóa trong phạm vi mục tiêu, giảm đáng kể chi phí nghiên cứu trong khi hoàn thành phát hiện khu vực mục tiêu.

Hi-MethylSeq kết hợp chuyển đổi sulfite, nhắm mục tiêu khuếch đại công nghệ giải trình tự thông lượng cao, cho phép phân tích định lượng chính xác methyl hóa đa phân đoạn, đa vị trí. Phương pháp này phù hợp cho các nghiên cứu methyl hóa của các đoạn mục đích quan tâm, xác nhận thêm các vị trí dương tính được lựa chọn bởi các nghiên cứu methyl hóa toàn bộ bộ gen trong các mẫu lớn.

Xử lý sulfite nặng là tiêu chuẩn vàng của quá trình xử lý DNA bộ gen trong quá trình methyl hóa DNA, là một quá trình hóa học, có thể gây tổn thương DNA, rất khó đạt được hiệu quả chuyển đổi 100% và duy trì tính toàn vẹn của DNA cùng một lúc, cả hai cần phải có sự cân bằng nhất định. Ba chuỗi đảo không phải CpG được chọn bên ngoài khu vực mục tiêu Hi-MethylSeq làm đối chiếu nội bộ để đánh giá chính xác tỷ lệ chuyển đổi của mẫu.