NameCông ty ra mắtcủaMiSeq là một trình tự mới tích hợp khuếch đại, giải trình tự và phân tích dữ liệu trên một thiết bị duy nhất, tạo ra hơn 1Gb dữ liệu mỗi lần chạy và chỉ chiếm diện tích 2 feet vuông. Quy trình và độ chính xác của MiSeq làm cho nó trở thành một nền tảng lý tưởng cho phân tích di truyền nhanh và tiết kiệm, phù hợp với nhiều ứng dụng. Illumina đã được FDA mua sắm với số lượng lớn và sắp được FDA chứng nhận, và vào tháng 10 năm 12, thông lượng giải trình tự của hệ thống MiSeq đã được nâng cấp lên khoảng 8G. Việc nâng cấp được thực hiện theo hai cách: tăng mật độ cluster, tăng mật độ cluster lên 15-17 triệu và đọc pair-end lên 30-34 triệu. Mặt khác, thông lượng được nâng lên bằng cách giải trình tự đọc dài, chiều dài giải trình tự đọc đạt 2 * 300bp, đồng thời tốc độ giải trình tự cũng được tăng lên. Hiện nay, Viện Broad đã sử dụng thuốc thử hiện có để thực hiện giải trình tự đơn đầu 300bp, Illumina hiện đã hoàn thành giải trình tự pair-end 2 * 400bp. Mà những thứ này, đều là bảo đảm dưới tiền đề kết quả số liệu chất lượng cao hoàn thành.

Thông số hiệu suất MiSeq

Illumina MiSeq Thời gian giải trình tự và lượng dữ liệu

Illumina MiSeq đọc nhiều hơn

quy trình làm việc

Trình tự thế hệ thứ hai illuminaMiSeq bốnTính năng lớn

Thời gian thử nghiệm ngắn hơn: Phải mất 8 giờ kể từ khi chuẩn bị mẫu để có được kết quả giải trình tự chất lượng cao hơn 100M.

Quy trình chuẩn bị mẫu thuận tiện: cần mẫu 50ngDNA, 2 giờ hoạt động tự động có thể hoàn thành toàn bộ công việc chuẩn bị mẫu.

Nguyên tắc giải trình tự: MiSeq tiếp tục nguyên tắc hóa học của GA và HiSeq Platform để giải trình tự cạnh tổng hợp.

Chức năng tích hợp đầy đủ: MiSeq có thể hoàn thành việc tạo cụm, giải trình tự hai chiều và phân tích dữ liệu một cách độc lập để tài trợ và không gian phòng thí nghiệm không còn là rào cản đối với nghiên cứu NGS.

Trình tự thế hệ thứ hai illuminaPhạm vi ứng dụng MiSeq

1, Giải trình tự nhóm phiên mã

Nền tảng giải trình tự Paisenor MiSeq là một nền tảng phân tích phiên mã cho các loài đã được giải trình tự bộ gen. Đội ngũ kỹ thuật của công ty hiện đã hoàn thành việc giải trình tự và phân tích nhóm phiên mã của nhiều loại thực vật, động vật, trong đó có cá ngựa vằn.

2, macro genome 16S rDNA giải trình tự vùng V đơn

Trình tự thông lượng cao của vùng V đơn (V3 V4) của 16s rDNA được thực hiện để xác định hệ vi khuẩn và hệ vi sinh cổ. Nhóm kỹ thuật của Paterno đã sử dụng Illumina MiSeq để giải trình tự 16S rDNA V4 và kết hợp với Roche 454 FLX+giải trình tự 16S rDNA V1~V3 để xác định thành công vi khuẩn môi trường đường ruột của gà.

Giải trình tự Small RNA

Chiều dài đọc 1 * 35bp phù hợp với chiều dài giải trình tự của RNA nhỏ, tốc độ nhanh và độ nhạy cao. Nhóm kỹ thuật của Paiseno hiện đã hoàn thành trình tự microRNA ở ngỗng và trình tự microRNA trong nhiều loại thảo mộc Trung Quốc.

4. Giải trình tự lại: bao gồm giải trình tự lại toàn bộ bộ gen, đơn giản hóa giải trình tự bộ gen, giải trình tự exon.

Illumina MiSeq rất thích hợp cho việc giải trình tự lại bộ gen của vi sinh vật, hoàn thành một trình tự bộ gen cho mỗi lần chạy. Vào ngày 27 tháng 12 năm 2011, đội ngũ kỹ thuật của Paisenow đã sử dụng MiSeq để hoàn thành việc giải trình tự lại vi khuẩn axit lactic (Lactobacillus casei Zhang và Lactobacillus casei P8), với độ sâu phủ sóng bộ gen lần lượt là 404 và 213 lần, so với trình tự tham chiếu, bộ gen đạt được độ phủ sóng đầy đủ, đồng thời phát hiện nhiều biến thể cấu trúc, bao gồm chèn, thiếu và các vị trí SNP, và phát hiện ra toàn bộ plasmid.

Hiển thị dữ liệu

* Giới thiệu sản phẩm và dữ liệu trên có nguồn gốc từ Illumina, chỉ để tham khảo, IlluminaLàm chuẩn.