Khối phổ có thể được sử dụng để giải trình tự protein không? - Công nghệ sinh học Patek

Khối phổ có thể được sử dụng để giải trình tự protein không? - Công nghệ sinh học PatekGiới thiệu chi tiết dịch vụ kỹ thuật phát hiện

I. Giới thiệu background

Việc giải trình tự của ngày có thể tiết lộ trực tiếp chuỗi axit amin của ngày, đó là cơ sở để hiểu cấu trúc và chức năng của ngày. Cấu trúc ba chiều của hạt có thể được dự đoán thêm sau khi trình tự protein được giải mã, từ đó phân tích các chức năng sinh học và cơ chế tương tác của nó. Điều này có ý nghĩa quan trọng để khám phá những bí ẩn của hoạt động sống và hiểu được sự xuất hiện và phát triển của bệnh tật. Các kỹ thuật giải trình tự protein hiện nay chủ yếu là: giải trình tự khối phổ từ đầu, suy thoái Edelman, giải trình tự nanopore. Hiện nay ứng dụng tương đối nhiều là giải trình tự từ đầu dựa trên khối phổ. Giải trình tự từ đầu (de novo protein sequencing) là một kỹ thuật giải trình tự hoàn toàn mới để xác định trực tiếp chuỗi axit amin từ đầu mà không phụ thuộc vào bất kỳ trình tự đã biết nào hoặc thông tin cơ sở dữ liệu từ đầu. Kháng thể hoạt động như các phân tử của bìbù kěshǎo trong hệ thống miễn dịch của chúng ta, là một công cụ có giá trị trong lĩnh vực chẩn đoán và điều trị y tế, và việc giải trình tự từ đầu có một ứng dụng quan trọng trong lĩnh vực kháng thể.

II. Quy trình kỹ thuật

Trình tự phân đoạn dựa trên khối phổ là việc sử dụng phổ khối để thu thập thông tin khối lượng về trình tự axit amin phân đoạn peptide, được gọi là phổ bậc hai, phân tích trình tự phân đoạn peptide trực tiếp từ khối phổ bậc hai bằng thuật toán giải trình tự từ đầu. Sau khi nối trình tự, bạn sẽ có được trình tự axit amin hoàn chỉnh. Quy trình kỹ thuật để giải trình tự zhìpǔ fǎd àǎ izì như sau: Chuẩn bị mẫu → Giải pháp hạt giống → Tách phân đoạn peptide → Kiểm tra phổ khối → Phân tích dữ liệu. ① Trong quá trình chuẩn bị mẫu, cố gắng tránh phân hủy mẫu; ② Chọn enzyme thích hợp để phân giải enzyme; ③ Đảm bảo hiệu suất ổn định của máy quang phổ khối và cải thiện độ chính xác của dữ liệu.

III. Dự án nghiên cứu

Bệnh globulin C đơn dòng (MGUS) là một bệnh tế bào plasma được đặc trưng bởi sự hiện diện của một kháng thể đơn dòng chính (tức là protein M) trong huyết thanh. Các tác giả đã phát hiện protein M của loại IgG1 trong huyết thanh của con người thông qua phân tích kết hợp sắc ký lỏng-khối phổ. Phân đoạn peptide kháng thể được phân tích bằng cách sử dụng nhiều protease để tạo ra các phân đoạn peptide kháng thể, sau khi ghép các phân đoạn peptide, zuì cuối cùng đã xác định chuỗi nặng và chuỗi nhẹ của protein M hoàn chỉnh. Ngoài ra, các tác giả mô tả mức độ glycosyl hóa trong vùng CDR của kháng thể.

Trình tự khối phổ có thể giúp khám phá các mục tiêu thuốc mới, cung cấp thông tin quan trọng cho việc thiết kế và sàng lọc thuốc. Thông qua kỹ thuật giải trình tự, các nhà khoa học có thể xác định các loại thuốc có liên quan đến bệnh và lần lượt thiết kế thuốc chống lại các loại thuốc này để đạt được điều trị jīngzhì. Với kỹ thuật giải trình tự dànbáizhì, các bác sĩ có thể đánh giá tình trạng bệnh của bệnh nhân và dự đoán xu hướng tiến triển của bệnh, từ đó phát triển một kế hoạch điều trị cá nhân hơn. Điều này không chỉ cải thiện hiệu quả điều trị mà còn giảm tác dụng phụ và nâng cao chất lượng cuộc sống của bệnh nhân.

Dựa trên các tài liệu được công bố trên tạp chí proteomics JPR của Nature Biotechnology và zhuānyè, Beijing Baitai Pike Biotechnology Co., Ltd đã phát triển phần mềm phân tích trình tự kháng thể kết hợp với kiến thức nền tảng zhuānyè hiện có, với phương pháp tính toán dữ liệu thô tự nghiên cứu về khối phổ, sử dụng nguyên tắc rộng vào hẹp để đạt được xác định chính xác trình tự kháng thể/protein mà không bỏ lỡ bất kỳ thông tin dữ liệu hợp lệ nào. Các khối phổ kế Orbitrap Eclipse và Orbitrap Fusion Lumos với độ phân giải và độ nhạy hiện tại được sử dụng trong quá trình giải trình tự để đảm bảo chất lượng dữ liệu và độ chính xác của kết quả. Dự án giải trình tự protein/kháng thể có chu kỳ từ 3 đến 4 tuần.

IV. Trích dẫn tài liệu

[1] Albert, Denboer, Arjand, et al. Phát hiện dựa trên quang phổ khối lượng trực tiếp và trình tự kháng thể của bệnh gamma đơn clonal có ý nghĩa không xác định từ huyết thanh bệnh nhân: Một nghiên cứu trường hợp [J]. Tạp chí Nghiên cứu Proteome, 2023, 22(9): 3022-3028.

Bandeira N, Pham V, Pevzner P, et al. tự động de novo protein trình tự của kháng thể đơn clonal [J]. Công nghệ sinh học tự nhiên, 2008, 26(12):1336-1338

Công nghệ sinh học Patei Pike

I. Giải trình tự protein

Công nghệ sinh học Patek Pyke phân tích trình tự dàbáizì bằng cách sử dụng khối phổ kế Obitrap Fusion Lumos mới ra mắt của Thermo và hệ thống giải trình tự thoái hóa Edman của Shimazu để cung cấp các dịch vụ phân tích trình tự protein dựa trên khối phổ bao gồm phân tích thành phần axit amin của dàbáizì, Nduāncèxú, Cduāncèxú và phân tích trình tự đầy đủ, cũng như dịch vụ phân tích trình tự đầu dàbáizì dựa trên sự thoái hóa Edman. Đối với các chuỗi lý thuyết chưa biết, các chuỗi protein được phân tích bằng cách cung cấp dịch vụ giải trình tự từ đầu dựa trên phương pháp giải trình tự từ đầu.

※ Lợi thế dịch vụ:

Áp dụng công cụ phổ khối tiên tiến hiện nay trên thế giới Obitrap Fusion Lumos;

2. Có thể đạt được độ che phủ 100% của trình tự protein mục tiêu được xác định;

3. Có thể xác định trình tự axit amin lên đến 70 ở đầu N của protein;

4. Mẫu có thể xác định nhiều dạng: dung dịch protein, dải protein PVDF;

5. Số lượng mẫu thấp: mẫu protein chỉ cần 5-10ug, có thể hoàn thành thử nghiệm;

6. Trình tự không bị ảnh hưởng bởi N-end đóng cửa, PEC và sửa đổi N-end như glycosyl hóa.

II. Nhóm học

Patek Pike Biotechnology sử dụng nền tảng phổ khối Orbitrap Fusion Lumos của Thermo Fisher kết hợp với Nano-LC để cung cấp một loạt các dịch vụ phân tích hệ thống phân tích hệ thống định lượng, hệ thống phân tích mục tiêu, hệ thống polypeptide, hệ thống protein biến đổi sau dịch thuật, v.v. Ngoài ra, Patek Park Biotechnology còn giới thiệu dịch vụ 4Ddánbáizì dựa trên timsTOF Pro, hỗ trợ các nghiên cứu về microsample proteomics, big sample group medicine và high flux modification.

※ Lợi thế dịch vụ:

1 . Phân tích protein định lượng thông lượng cao: phân tích thực nghiệm quy mô lớn trong nhóm kiểm soát đa, phát hiện ra các dấu hiệu sinh học mới;

2. Nhiều phương pháp đánh dấu khác nhau trong cơ thể và ngoài cơ thể, thích hợp để phân tích nhiều mẫu như mô, tế bào, máu;

3. Độ nhạy cao trong phân tích phổ khối và độ lặp lại cao của kết quả thí nghiệm;

4. Có thể phát hiện protein phong phú thấp hơn, phạm vi tuyến tính rộng;

5. Phân tích tin sinh học zhuānyè, phân tích chính xác hơn một cách có hệ thống.

B5-03=giá trị thông số Ki, (cài 3)

Công nghệ sinh học Patek Pyke sử dụng hệ thống dòng chảy khối phổ Fluidigm để phân tích kỹ thuật dòng chảy khối phổ đơn bào, sử dụng các dấu hiệu nguyên tố kim loại (thường là kháng thể đặc hiệu được đánh dấu bởi các nguyên tố kim loại) để đánh dấu các phân tử trên bề mặt và bên trong tế bào, sau đó tách các tế bào riêng lẻ bằng nguyên tắc dòng chảy, sau đó phân tích phổ khối lượng nguyên tử của các tế bào riêng lẻ bằng phổ khối plasma kết hợp điện cảm (ICP-MS), sau đó chuyển đổi dữ liệu phổ khối lượng nguyên tử thành biểu hiện phân tử tín hiệu trên bề mặt và bên trong tế bào.

※ Lợi thế dịch vụ:

1. Công nghệ tiên tiến, lấp đầy khoảng trống công nghệ

Công nghệ kháng thể đánh dấu kim loại được sử dụng để tránh các vấn đề với ít kênh huỳnh quang dòng chảy truyền thống và dễ ảnh hưởng lẫn nhau. Có thể mô tả đồng thời nhiều chỉ số ở cấp độ đơn bào, công nghệ sinh học Patek có thể phát hiện đồng thời 51 protein mục tiêu.

2. Số lượng phân tích lớn và chi phí thấp hơn

RNAseq đơn bào bị giới hạn bởi các yếu tố như chi phí, tổng số phân tích của tất cả các tế bào mẫu thường là khoảng 2x10^4, trong khi kỹ thuật phổ khối dòng (một mẫu) có thể phân tích ít nhất 10^5 tế bào một lần, đạt được sự gia tăng theo thứ tự độ lớn và chi phí không cao hơn RNAseq đơn bào.

3. Triển vọng ứng dụng lớn

① Kết quả phổ khối dòng chảy có thể cho những thay đổi trong quần thể tế bào, có triển vọng nghiên cứu lớn trong chẩn đoán lâm sàng, nghiên cứu cơ chế bệnh, v.v.

b) Kết hợp công nghệ nhãn kim loại với các công nghệ khác sẽ có hướng ứng dụng mới. Ngoài protein thông thường, công nghệ tế bào dòng chảy khối phổ có thể được sử dụng để sửa đổi sau khi dịch protein;

③ Có thể phát hiện sự sống còn của tế bào, kích thước tế bào, biểu hiện phiên mã mRNA, tốc độ tổng hợp DNA và hoạt động protease, v.v.

Ký hợp đồng cung cấp Phần mềm tính toán định lượng rủi ro ngoài khơi – Safeti Offshore cho Trung tâm nghiên cứu và phát triển An toàn và Môi trường Dầu khí (CPSE) (

Giải pháp một cửa cho phân tích miễn dịch polypeptide dựa trên khối phổ chính xác cao và khám phá kháng nguyên mới của Patek Biotechnology bao gồm chương trình xác định và làm giàu peptide miễn dịch độc quyền và nhạy cảm cao của chúng tôi. Chúng tôi có thể giúp bạn xác định và xác định hơn 10.000 polypeptide loại I và hơn 10.000 polypeptide loại II. Phân tích hệ miễn dịch peptide được thực hiện thông qua nền tảng phân tích hệ miễn dịch polypeptide thông lượng cao được tối ưu hóa của chúng tôi cho phép xác định và định lượng lặp lại từ vật liệu mẫu nhỏ. Dịch vụ này có thể được áp dụng cho các nghiên cứu quy mô lớn nhằm giúp các nhà khoa học tìm ra giải pháp cho ung thư, bệnh miễn dịch và bệnh truyền nhiễm, đào sâu vào các mục tiêu chưa biết.

V. Mô tả thuốc sinh học

Patei Pike dựa trên công nghệ quang phổ khối độ phân giải cao, MALDI TOF， Công nghệ phân tách sắc ký hiệu quả cao, cung cấp một loạt các sơ đồ phân tích dược phẩm sinh học, từ thành phần axit amin và phân tích cấu trúc cấp I của các sản phẩm sinh học như hạt dẻ, polypeptide, kháng thể, vắc-xin, đến phân tích độ biến thiên và độ tinh khiết của sản phẩm. Nhằm cung cấp dịch vụ phân tích thuốc sinh học chất lượng cao, giúp các nhà sản xuất thuốc sinh học nâng cao chất lượng thuốc sinh học.

Bảy nền tảng phát hiện công nghệ sinh học Patek

B5-05=giá trị thông số Kd, (cài 2)

Bắc Kinh Baitai Pike Công nghệ sinh học Công ty TNHH cam kết cung cấp dịch vụ zhuānyè như kiểm tra kiểm soát chất lượng và xác minh dự án cho ngành công nghiệp sinh học/dược phẩm và thiết bị y tế. Phòng thí nghiệm của công ty tuân theo các quy định và nguyên tắc hướng dẫn của NMPA, ICH, FDA và EMA, v.v., đã thông qua chứng nhận hệ thống chất lượng kép CNAS/ISO9001, thiết lập hệ thống chất lượng hoàn chỉnh, sao lưu dữ liệu nóng/lạnh, xác minh định kỳ/thời gian thiết bị, theo dõi kiểm toán phần mềm, cung cấp cho khách hàng các giải pháp và dịch vụ kỹ thuật tích hợp, hỗ trợ nghiên cứu và phát triển thuốc mới, đăng ký kê khai thuốc và phát hành sản xuất.

1. Công ty áp dụng hệ thống kiểm soát chất lượng ISO9001, zhuānyè cung cấp dịch vụ phân tích phát hiện CRO dựa trên phổ khối;

2. Được công nhận bởi phòng thí nghiệm CNAS quốc gia, cung cấp cho khách hàng dịch vụ nghiên cứu chất lượng thuốc phù hợp với các quy định dược phẩm toàn cầu;

3. Phạm vi kinh doanh bao gồm hệ thống phân tích, polypeptide, hệ thống trao đổi chất, đặc tính dược phẩm sinh học, phân tích tế bào đơn, dòng chảy phổ khối đơn bào, phân tích đám mây tín hiệu sinh học cũng như phân tích tích hợp phổ chất sinh viên nhiều nhóm, v.v.

4. Bảy nền tảng kiểm tra kiểm soát chất lượng để đáp ứng nhu cầu dịch vụ một cửa của bạn;

5. Phục vụ 3000+doanh nghiệp, 10000+khách hàng lựa chọn;

6. Cam kết cung cấp cho bạn dịch vụ phân tích phổ sinh khối chất lượng cao!

Khối phổ có thể được sử dụng để giải trình tự protein không? - Công nghệ sinh học PatekGiới thiệu chi tiết dịch vụ kỹ thuật phát hiện