Phân tích kiểu hình nội hàm cao ngày càng được sử dụng rộng rãi trong nhiều lĩnh vực nghiên cứu, bao gồm nghiên cứu chức năng gen, nghiên cứu dược phẩm và độc tính học. Ưu điểm của phương pháp này là thu thập thông tin đa chiều rất khách quan từ một mức độ nhỏ, có thể phân tích và mô tả trạng thái của từng tế bào và so sánh với dữ liệu phân tích tổng thể. Trong khi đó, nhiều phân tích kiểu hình truyền thống là trong con đường nghiên cứu, chỉ chọn một số ít các chỉ số quan trọng để phân tích.1Do đó, trong phân tích kiểu hình truyền thống, hầu hết các thay đổi liên quan đến sinh học do xử lý thực nghiệm có thể dễ dàng bị bỏ qua.
Phân tích kiểu hình của một tế bào bao gồm hàng ngàn chỉ số có thể định lượng mô tả trạng thái của tế bào. Các chỉ số này chứa thông tin được rút ra từ biểu hiện, cấu trúc và phân phối sinh trắc học. Thông thường, các dấu hiệu này được xác định cụ thể bởi các bào quan và cung cấp thông tin về cấu trúc, mối quan hệ không gian của chúng với các cấu trúc phụ tế bào khác. Thông tin phân loại của các tế bào này có thể cung cấp cho khách hàng cơ sở phân tích hiệu quả khi nghiên cứu các hợp chất, chất phân tử nhỏ hoặc rối loạn gen. Các hợp chất có cơ chế hoạt động tương tự (MOA) thường dẫn đến những thay đổi hình thái tế bào tương tự. Do đó, sự so sánh giữa các phổ kiểu hình có thể cung cấp cơ sở cho MOA của hợp chất mới.3Tương tự như vậy, sự can thiệp di truyền trong cùng một con đường thường dẫn đến một hồ sơ kiểu hình tương tự, cho thấy phổ kiểu hình có thể được sử dụng cho nghiên cứu gen chức năng thông lượng cao.7。