Máy điện di mao mạch (CE) là một công nghệ tách pha lỏng sử dụng điện trường DC cao áp làm động lực và mao mạch làm kênh tách. Nguyên tắc cốt lõi của nó là tách hiệu quả dựa trên sự khác biệt về tốc độ di chuyển của các hạt tích điện trong điện trường. Trong hệ thống điện di mao dẫn, mao dẫn thạch anh có đường kính trong 20-200 μm được lấp đầy với một bộ đệm, và khi áp suất cao 10-30 kV được áp dụng, các hạt tích điện di chuyển dưới tác động của điện trường, tốc độ di chuyển của chúng được xác định bởi sự kết hợp của dòng điện di (liên quan đến điện tích phân tử, kích thước) và dòng điện di (EOF). Dòng điện thấm có nguồn gốc từ điện tích âm được tạo ra bởi sự phân ly hydroxyl silic trong thành mao mạch, thu hút các cation trong bộ đệm để tạo thành một lớp điện kép, đẩy chất lỏng toàn bộ về phía cathode dưới áp suất cao, tốc độ của nó thường là một thứ tự cường độ lớn hơn so với dòng điện di, trở thành động lực chính của sự tách biệt. Các hạt tích điện dương chảy ra đầu tiên do sự di chuyển đồng hướng với dòng điện thấm, tiếp theo là các hạt trung tính và các hạt tích điện âm chảy ra cuối cùng, do đó đạt được sự tách thành phần.