Tác hại của pin phế liệu chủ yếu tập trung vào ba chất kim loại nặng chứa trong pin, đó là thủy ngân, cadmium và chì. Pin đã qua sử dụng bị loại bỏ ngẫu nhiên sau khi hao mòn và ăn mòn lâu dài, các chất độc hại kim loại nặng bên trong pin sẽ rò rỉ ra ngoài, thông qua các con đường khác nhau vào chuỗi thức ăn của con người, gây ra mức độ nguy hiểm khác nhau cho cơ thể con người và môi trường sinh thái.